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普渡大學農業(yè)與生物工程學院開設的研究生學位項目有MS和PhD兩種，專業(yè)方向包括：
農業(yè)與生物工程
農業(yè)系統(tǒng)管理
生物工程與技術
生物與食品加工工程
生態(tài)科學與工程
流體工程
普渡大學農業(yè)與生物工程學院研究生項目要求申請者本科畢業(yè)，擁有非工程學專業(yè)背景，除基本的硬件條件外，還需準備相關研究或工作經驗，學習過特定前置課程，有相關研究領域導師的推薦信。所有錄取的學生均可獲得院里提供的獎學金，以TA/RA/Fellowship為主。
| 排名 | 學校 | 專業(yè)（major） |
|---|---|---|
| 1 | 愛荷華州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 1 | 普渡大學西拉法葉分校 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 3 | 康奈爾大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 3 | 德州農工大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 3 | 加州大學戴維斯分校 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 3 | 佛羅里達大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 7 | 伊利諾伊大學香檳分校 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 8 | 北卡羅來納州立大學羅利分校 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 9 | 俄亥俄州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 9 | 內布拉斯加大學林肯校區(qū) | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 11 | 密歇根州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 12 | 匹茲堡州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 12 | 威斯康星大學麥迪遜分校 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 12 | 弗吉尼亞理工大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 15 | 堪薩斯州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 16 | 肯塔基大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 17 | 俄克拉荷馬州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 17 | 科羅拉多大學波德分校 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 19 | 奧本大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 20 | 路易斯安那州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 20 | 北達科他州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 20 | 阿肯色大學費耶特維爾分校 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 20 | 華盛頓州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 24 | 亞利桑那大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 24 | 佐治亞大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 26 | 密西西比州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 26 | 俄勒岡州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 26 | 南達科他州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 26 | 密蘇里大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 26 | 田納西大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 31 | 西北大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
| 32 | 猶他州立大學 | 生物工程/農業(yè)工程 |
